玉米种子耐储性的全基因组关联分析及候选基因预测

作者：孙晓慧; 李春翔; 刘玲玲; 刘杉; 韩笑; 付畅; 周羽; 曾兴; ***; 邸宏^*

来源：玉米科学, 2021, 29(06): 29-34.

DOI：10.13597/j.cnki.maize.science.20210605

• 玉米
• 种子耐储性
• 关联分析
• 候选基因

以197份玉米自交系为试材,人工加速老化后进行标准发芽试验,检测种子耐储性相关表型性状,结合平均分布于玉米基因组的SNP标记进行关联分析,挖掘关联SNP位点和候选基因。结果表明,共检测出8个与相对发芽势(RGE)、相对发芽指数(RGI)、相对活力指数(RVI)和相对简易活力指数(RSVI)等性状呈显著关联的SNP位点(P<0.000 1),分布于染色体bin1.08、bin3.08、bin4.03、bin4.05和bin6.05区域;PZE-104063000、PZE-104064763和PZE-106085414这3个SNP位点均与2个性状关联。预测到7个候选基因,分别与纤维素合成酶活性、翻译起始因子、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性、磷酸二酯酶活性、类囊体膜组分、脂肪酸生物合成酰基转运活性和微管有关组分等相关。

• 单位
  东北农业大学