基于RNA-Seq测序技术揭示慢性乙型肝炎病理过程的分子机制

作者：梁茜; 李江; 李朋; 陈新^*

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(11): 5347-5355.

DOI：10.13417/j.gab.039.005347

• 慢性乙型肝炎
• 转录组
• 病理变化
• 分子机制

为表征慢性乙型肝炎(CHB)疾病过程病理功能的变化情况,本研究入组了10例CHB患者和14例健康对照组(NC),提取各研究对象的外周血单核细胞(PBMC)进行转录组测序。通过转录组分析获得CHB患者中特异性表达基因。基于基因网络协同分析发现组学变化共同影响的生物学功能,提取疾病相关的重要病理生理变化,追踪最大贡献度分子指标。最后基于线性回归分析构建个体生理状态打分模型。结果表明:CHB组和健康组间显著差异表达基因共有554个,其中CHB组表达上调基因共有232个,表达下调基因共有323个。功能分析发现CHB病理过程中病毒转录、代谢紊乱等功能发生显著变化,同时炎症反应和凋亡相关的生物学过程也发挥重要作用。并且发现了SFPQ、MSH2、STIP1这3个基因在CHB患者特异性表达并参与重要的生理功能,构建多重打分模型能够区分CHB和NC。本研究基于组学技术阐述了CHB生理病理状态改变情况,为阻止CHB恶化发展为终末期肝病的研究提供理论依据。

• 单位
  浙江大学附属第一医院; 浙江大学