一株MLB1型星状病毒全基因组序列分析

作者：王雅璐; 秦萌; 高升辉; 李静欣; 毛彤瑶; 李丹地; 李利利; 赵璐; 李金松^*; 吴建军; 段招军

来源：病毒学报, 2022, 38(06): 1315-1321.

DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.004166

• 新型星状病毒
• MLB1
• 腹泻病毒

了解我国MLB1型星状病毒基因组特征，为星状病毒腹泻的防控提供基础数据。使用星状病毒通用引物筛查北京市丰台区2017年72份儿童腹泻监测病例标本；扩增MLB星状病毒全基因组序列，采用在线比对、进化、重组等生物学信息学方法分析MLB1的全基因组序列。从72份标本中检出2份1型星状病毒（2.78%）和1份MLB1型星状病毒（MLB1-FT）(1.39%)。MLB1-FT与GenBank已报道的MLB1型星状病毒全基因组相似性为92.51%～98.28%;MLB1-FT的三个ORF区，仅5个位点氨基酸与其他株均不相同。依据其ORF2部分序列的进化分析，MLB1可分为A和B两个组，其中A组可分为a和b亚组，MLB1-FT为A组中的b亚组。未发现MLB1-FT具有重组现象。MLB1-FT具有星状病毒特征性的保守基序，部分保守基序与其他型别星状病毒不一样，为MLB1星状病毒特有。MLB1-FT具备新型星状病毒MLB的典型特征。我国新型星状病毒监测力度较弱，应加强监测。

• 单位
  中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所; 甘肃中医药大学; 公共卫生学院