链霉菌看家基因引物的设计与验证

作者：郭银平; 黄英

来源：微生物学报, 2007, (06): 1080-1083.

DOI：10.13343/j.cnki.wsxb.2007.06.002

• 看家基因
• 引物
• 链霉菌
• 扩增
• 测序
• 高(G+C)mol% housekeeping gene
• primer
• streptomycetes
• amplification
• sequencing
• high G+C mol%

看家基因的扩增与测序是进行多基因系统进化分析首先需要解决的问题。针对链霉菌这一群高(G+C)mol%革兰氏阳性细菌,选定4个看家基因:atpD、recA、rpoB和trpB,利用NCBI数据库中已有的2个链霉菌和3个分枝杆菌的全基因组序列,以及另两个链霉菌的recA基因序列,通过软件分析设计了各基因的扩增和测序引物,并优化了扩增反应条件。从所试验的55株链霉菌中,均特异地扩增出了上述4个基因的片段,并成功进行了序列测定,验证了所设计引物的实用性。所归纳的引物设计方法可用于高(G+C)mol%革兰氏阳性细菌的其它看家基因,以促进多基因系统进化研究的开展。

• 单位
  中国科学院研究生院; 中国科学院微生物研究所; 微生物资源前期开发国家重点实验室