玉米自交系I18人工接种大斑病菌的mRNA表达分析

作者:柳兵; 张辰; 王宇琪; 赵仁贵*
来源:东北农业科学, 2019, 44(05): 43-47.
DOI:10.16423/j.cnki.1003-8701.2019.05.010

摘要

本研究对高感玉米自交系I18人工接种大斑病菌,经叶片表型鉴定,叶片病斑呈现增多且扩大的趋势。结果表明,对照与处理检测的表达基因与新基因数目不同,新基因占表达基因比例范围是11.95%~12.87%。自交系I18处理1,处理2、处理3共检测到1 401个共表达基因,上调基因926个,下调基因429个。从韦恩图可以看出,玉米接种大斑病后的基因共表达以上调为主,呈现被诱导激活的趋势,小部分基因表达受到抑制。随着大斑病侵染时间的增加,上调的基因数目呈现先增加后降低的趋势,下调的基因数目呈现升高的趋势,通过使用BLAST软件,对8大数据库进行序列比对,发掘1个下调的新基因,5个上调基因。经GO基因库进行功能注释,本试验检索检测到33 370个基因,分类得到32 048个注释基因,注释率达到96%。