黄姑鱼耐寒相关基因CIRP、nefm的克隆及表达特征分析

作者：田璐; 游翘楚; 迟长凤; 宋红彬; 楼宝; 徐冬冬^*

来源：浙江海洋大学学报(自然科学版), 2019, 38(04): 286-308.

• 黄姑鱼
• 冷胁迫
• CIRP
• nefm
• qRT-PCR

为了研究黄姑鱼耐低温相关的基因,对耐寒候选基因冷诱导RNA结合蛋白CIRP(cold-inducible RNA-binding protein)和神经微丝蛋白nefm(neurofilament medium polypeptide)进行了克隆并分析其在低温下的表达模式。通过同源克隆和5’/3’Race的方法扩增得到耐寒候选基因CIRP和nefm基因的cDNA核心序列。CIRP基因cDNA核心序列为3 460 bp,其开放阅读框为543 bp,编码180个氨基酸;nefm基因cDNA核心序列为1 116 bp,其开放阅读框为1 107 bp,编码369个氨基酸。采用N-J bootstrap方法构建的系统进化树同源性分析表明黄姑鱼的CIRP和nefm氨基酸序列分别与银鳕和大黄鱼的相似度最高。利用qRT-PCR分析2个基因在脑、鳃、肝和肾等4个组织中随低温胁迫的相对表达量变化,结果显示CIRP和nefm基因在上述4个组织中都发生显著变化,表明这2个基因可能都参与了黄姑鱼抵抗低温胁迫的过程,可以作为抗寒或选育等相关研究的候选基因。

• 单位
  浙江省海洋水产研究所; 浙江海洋大学