新疆褐牛乳房炎抗性相关基因的表达及生物信息学分析

作者：姜徽; 刘攀; 李媛媛; 刘奎国; 黄锡霞^*; 刘江卫; 胥磊; 杜建文; 桑扎根; 杨雪梅; 赵番番; **

来源：中国畜牧兽医, 2020, 47(01): 90-97.

DOI：10.16431/j.cnki.1671-7236.2020.01.011

• JAK2基因
• STAT5A基因
• 实时荧光定量PCR
• 乳房炎抗性
• 新疆褐牛

文章旨在分析新疆褐牛乳房炎抗性相关基因的分子生物学功能,为分子标记辅助育种工作在新疆褐牛乳房炎抗性性状中的研究奠定理论基础。试验采用DAVID 6.8软件对课题组前期研究及相关文献报道的乳房炎抗性相关基因(共20个基因)进行功能GO富集及KEGG信号通路分析。采用String 10.0数据库进行蛋白相互作用网络分析,结合生物信息学分析和相关文献的研究结果,挑选出JAK2和STAT5A基因,通过使用实时荧光定量PCR技术检测JAK2、STAT5A基因在不同乳房健康程度的新疆褐牛血液中的相对表达量。GO富集分析得到,20个基因主要涉及细胞膜、免疫应答和调节防御反应等生物过程;KEGG富集分析发现,这些基因主要参与JAK-STAT信号通路、趋化因子信号通路、ErbB信号通路等;PPI分析发现,20个基因中有8个基因之间存在直接或间接联系;实时荧光定量试验发现,JAK2、STAT5A基因在健康新疆褐牛血液的表达量极显著或显著高于患乳房炎新疆褐牛(P<0.01;P<0.05)。通过生物信息分析和实时荧光定量试验,进一步从分子水平探讨了不同乳房健康程度的新疆褐牛与JAK2、STAT5A基因表达之间的内在联系。

• 单位
  动物科学学院; 新疆农业大学