本实用新型公开了一种燃料电池微观结构测试系统,涉及数字射线成像技术领域,包括射线源、成像组件和盛装组件,盛装组件内用于放置燃料电池,射线源和成像组件分别设置于盛装组件的两侧,且射线源能够发出射线照射并穿过燃料电池,成像组件能够接收穿过燃料电池的射线并对燃料电池内部结构成像。该燃料电池微观结构测试系统能够为准确地表征燃料电池的孔隙率、有效三相界面长度等微观结构提供基础。