新疆地区哮喘的下呼吸道细菌群多样性研究

作者：朱奇; 雍军^*; 李林格

来源：国际遗传学杂志, 2020, (02).

• 哮喘
• 下呼吸道
• 菌属

目的 利用高通量测序技术分析新疆地区汉族感染性哮喘和健康对照个体下呼吸道细菌多样性。方法 通过收集病例组20例汉族感染性哮喘患者和正常对照组8例汉族健康人的痰液,提取痰液DNA,对测序区域进行PEF扩增,利用Illumina Miseq测序平台对细菌的细菌核糖体16S小亚基基因(16S rDNA)区进行高通量测序,并对测序结果进行生物信息学分析。结果 ①哮喘患者和正常对照组可检测到的细菌种数相比,哮喘患者OTU(operational taxonomic units)数目明显低于正常对照组(P＝0.024)；香农-威纳指数(shannon Wiener index)、辛普森指数(simpson’s diversity index)、盖度(coverage)指数哮喘患者和正常对照组相比差异无统计学意义(P值分别为0.180、0.180、0.062)；②在门水平下病例组丰度高的主要包括链球菌(Streptococcus)、普氏杆菌(Prevotella)、韦氏杆菌(Neisseria Veillonella)、嗜血杆菌(Haemophilus),正常对照组丰度高的主要包括Streptococcus、Prevotella、Neisseria Veillonella、Haemophilus,两个组丰度高的主要包括Actinobacteria(25.22%)、Firmicutes(43.25%)、Bacteroidetes(20.38%)；③在属水平下对病例组和正常对照组中丰度差异最明显的菌属为：罗斯氏菌属(Rothia),拟普雷沃菌属(Alloprevotella),放线菌属(Actinomyces)。病例组中Rothia菌属丰度明显高于正常对照组(P＝0.006),Actinomyces菌属丰度明显高于正常对照组(P＝0.040),而正常对照组中Alloprevotella菌属明显高于病例对照组(P＝0.048),差异具有统计学意义。结论 哮喘患者和健康人相比较下呼吸道内菌群多样性主要的菌门和菌属存在明显变化,微生物去罗结构多样性变化是哮喘发生的重要机制,有待进一步研究。

• 单位
  新疆医科大学第一附属医院