吉林省2016年手足口病患儿肠道病毒71型VP1编码区基因分析

作者：魏雷雷; 吴东林^*; 黄飚; 王岙; 苟伟民; 杨尧; 王爽; 单元春

来源：中国生物制品学杂志, 2018, 31(11): 1215-1218.

DOI：10.13200/j.cnki.cjb.002360

• 手足口病
• 肠道病毒71型
• 氨基酸位点
• 变异
• C4a基因亚型

目的分析吉林省2016年肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)流行株基因学特征及其变异情况。方法采集2016年吉林省9个市、州送检的临床诊断为手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)298份标本,分离病毒获得阳性分离物,利用逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增阳性分离物VP1编码区,并对扩增产物进行核苷酸序列测定,应用Mega6和Bioedit 7. 01软件分析扩增序列基因亲缘关系和氨基酸位点变异。结果吉林省2016年分离的38株EV71同属于C4a基因亚型,并在VP1编码区共发生7处氨基酸位点的变异。结论吉林省2016年EV71流行株与C4a代表株位于同一分支属于C4a基因亚型,且发生了多位点氨基酸变异。

• 单位
  吉林省卫生监测检验中心; 吉林省疾病预防控制中心