敦化市2009-2011年致手足口病流行肠道病毒71型基因特征分析

作者：田丽敏; 荆铎; 魏雷雷; 王爽; 田鑫; 曹凤瑞; 程涛; 单元春; 常新; 李大强; 吕淑梅

来源：疾病监测与控制, 2014, 8(06): 358-359.

• 手足口病
• 肠道病毒71型
• 基因特征

目的分析吉林省敦化市流行的肠道病毒71型分离株的基因特征。方法对2009-2011年敦化市手足口病来源的3株EV71分离株进行逆转录-聚合酶链反应扩增VP1基因编码区后进行序列测定,并使用Bioedit和Maga4生物信息学软件进行基因特征分析。结果敦化市3株EV71流行株均为C4a基因亚型,3株EV71分离株之间核苷酸同源性为98.6%98.8%;与吉林省和龙市的流行株核苷酸同源性为98.8%99.8%,与吉林省其他地区的2株EV71代表株的核苷酸同源性为97.6%99.3%,与安徽省阜阳市2008年代表株的核苷酸同源性为98.3%99.3%。敦化市3株EV71分离株之间、与2008年阜阳株以及吉林省2009-2011年3株代表株的氨基酸同源性均达到100%。结论敦化市3株EV71分离株与同为延边州的和龙市的流行株核苷酸同源性最高,与安徽省阜阳市2008年流行株的核苷酸也具有较近的同源性。敦化市3株EV71分离株之间以及与中国C4a基因型代表株之间都具有较高的氨基酸同源性。

• 单位
  吉林省疾病预防控制中心