二代测序技术在微生物和感染性疾病中的应用

作者：黄晶晶; 肖盟; 徐英春^*

来源：协和医学杂志, 2018, 9(05): 448-452.

DOI：10.3969/j.issn.1674-9081.2018.05.014

• 二代测序技术
• 临床微生物学
• 感染性疾病

随着感染性疾病防治在卫生保健方面的重要性日益凸显,感染性疾病引起的社会关注逐渐增多,新技术在人类预防和控制病原体传播方面发挥着巨大作用。微生物实验室作为病原体检测的一线科室,通过镜检、培养、鉴定、药敏等方法,在感染控制中发挥着重要作用。传统分子诊断和基因分型方法提供的信息有限,通常不能满足疫情暴发和传播调查需求。二代测序技术(next-generation sequencing,NGS)在单次序列测定中可确定菌株基因组完整的DNA序列,并从这些数据中得到抗菌药物耐药性、毒力及分型等可用于疫情调查的信息,进一步用于开展疫情特异性筛查。本文概述NGS技术及其在医院感染性疾病暴发调查、未知病原体鉴定、毒力分析、耐药基因组研究等临床微生物领域中的应用。

• 单位
  中国医学科学院北京协和医学院; 北京协和医院