霍乱弧菌分型噬菌体VP2部分生物学特性及基因组分析

作者：孙惠惠; 范宇峰; 李臻鹏; 赵硕; 王晓勋; 逄波; 阚飙^*

来源：疾病监测, 2021, 36(09): 932-937.

• 分型噬菌体VP2
• 霍乱弧菌
• 生物学特性
• 基因组分析

目的对霍乱弧菌分型噬菌体VP2基因组、蛋白质组和增殖特征等开展分析,获取VP2的生物学特征。方法电镜观察噬菌体VP2的形态,测定最佳感染复数和一步生长曲线;通过在线RAST(https://rast.nmpdr.org/)对噬菌体VP2基因组进行编码基因预测及功能注释;提取VP2成熟颗粒中的蛋白质进行质谱分析;使用pyani进行噬菌体全基因组平均核苷酸一致性(ANI)聚类分析。结果噬菌体VP2为典型的20面体短尾噬菌体,最佳感染复数为1∶100,一步生长曲线结果显示其潜伏期大约为60 min,60～120 min为暴发期,120 min后为稳定期。预测存在49个开放阅读框(ORF),VP2成熟颗粒蛋白质谱分析显示有34个蛋白与预测的基因相对应,ANI结果显示,VP2与弧菌噬菌体CJY的ANI最高。结论明确了分型噬菌体VP2的基本生物学和基因组特征,获得成熟颗粒中包含的蛋白成分,为后续研究同源噬菌体及其与霍乱弧菌的相互作用提供了基础。

• 单位
  中国疾病预防控制中心环境与健康相关产品安全所; 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所