脒类KARI酶抑制剂的分子对接和3D-QSAR研究

作者：王宝雷; 王建国; 马翼; 李正名; 李永红; 王素华

来源：Acta Chimica Sinica, 2006, (13): 1373-1378.

• KARI酶
• 分子对接
• 三维定量构效关系

对设计合成的20个单脒类化合物的水稻KARI酶体外抑制活性和体内除草活性进行了分子对接和三维定量构效关系研究.前者采用AutoDock3.0方法,研究发现化合物活性变化趋势与分子对接计算结果基本一致,通过分析化合物9与KARI酶活性氨基酸残基结合模式发现,残基Glu319,Asp315,Glu496,Gly253,Met254,Cys517等对氢键和静电相互作用以及疏水作用都有重要贡献;后者研究采用比较分子力场分析(CoMFA)方法,结果表明立体场和静电场对活性的贡献分别为67.8%和32.2%,交叉验证系数rc2v=0.774,非交叉验证r2=0.999,F=1593.134,标准偏差s=0.036,所建立的3D-QSAR模型对化合物除草活性具有较好的预测能力.两种方法研究结果为进一步设计合成更高活性的KARI酶抑制剂提供了指导.

• 单位
  元素有机化学国家重点实验室; 南开大学