葡萄蚕豆萎蔫病毒中国分离物基因组全长序列分析

作者：张宝东; 范旭东^*; 张尊平; 任芳; 胡国君; 李晨; 贾晓君; 董雅凤^*

来源：植物病理学报, 2022, 52(04): 601-612.

DOI：10.13926/j.cnki.apps.000594

• 葡萄
• 葡萄蚕豆萎蔫病毒
• 基因组
• 序列分析

葡萄蚕豆萎蔫病毒(grapevine fabavirus, GFabV)是近年报道的葡萄新病毒，与葡萄褪绿斑驳、皱缩等症状发生相关，严重影响葡萄长势。本研究采用小RNA测序结合Sanger测序方法分别对表现褪绿斑驳的‘贝达’和无症状的‘赤霞珠’葡萄中的GFabV分离物进行基因组全长序列测定，获得了GFabV分离物LN＿BETA2和LN＿CXZ的基因组全长序列，其RNA1基因组全长分别为5 824 bp和5 823 bp, RNA2基因组全长分别为3 132 bp和3 135 bp。LN＿BETA2与LN＿CXZ的RNA1编码的多聚蛋白核苷酸序列之间的同源性为81.7%,与其他GFabV分离物多聚蛋白核苷酸同源性分别为73.4%～99.5%和73.5%～82.5%;LN＿BETA2和LN＿CXZ的RNA2编码的多聚蛋白核苷酸同源性为83.8%,与其他GFabV分离物多聚蛋白核苷酸同源性为75.0%～83.3%和68.2%～98.6%。系统进化树分析结果显示，在RNA1基因组中，LN＿BETA2划分在组3,LN＿CXZ形成单独的分支。RNA2基因组中，LN＿BETA2和LN＿CXZ分别划分在组3和组5中。本研究首次报道了GFabV中国分离物基因组全长序列，可为今后GFabV生物学特性及致病性研究提供工作基础。

• 单位
  中国农业科学院果树研究所