分子通讯与木聚糖酶耐热性的关系研究

作者：王馨颖; 李心羽; 冯一诚; 胡凯惠; 丁彦蕊^*

来源：基因组学与应用生物学, 2021, Z3: 3106-3114.

DOI：10.13417/j.gab.040.003106

• 频繁路径挖掘
• 耐热性
• 木聚糖酶

复杂网络是研究木聚糖酶耐热机制的有效方法。本研究构建来自嗜热子囊菌的耐热型木聚糖酶(Thermoascus aurantiacus xylanase, Xyna＿Theau)和来自变铅青链霉菌的常温型木聚糖酶(Streptomyces lividans xylanase, Xyna＿Strli)的残基相互作用网络，并利用Dijkstra算法与基于图的频繁模式挖掘算法进行频繁路径挖掘。结果表明：同温度下，Xyna＿Strli的通讯较Xyna＿Theau更为活跃，受到温度升高的影响更大；Xyna＿Strli的频繁路径集中在β1、β2与loop8、β7区域；而Xyna＿Theau的频繁路径则紧密联系了β1、β2、β3区域，并且也发现两蛋白质部分区域间通讯路径相同；此外，对比发现温度升高时Xyna＿Strli的通信受到C端，turn转折以及热敏感区域影响较大。

• 单位
  江南大学