福建省宁德港地区2020年夏季鼠形动物汉坦病毒基因特征分析

作者：王秋伟; 黄鹏; 岳明; 黄恩炯; 蔡怡珊; 梁培栋; 姚苹苹; 张云; 谭伟龙^*; 喻荣彬^*

来源：中华流行病学杂志, 2021, 42(07).

• 汉坦病毒
• 基因变异
• 遗传进化
• 鼠形动物

目的分析2020年夏季福建省宁德港地区(宁德港)鼠形动物携带汉坦病毒基因特征及遗传进化关系。方法夹夜法采集宁德地区鼠类, 提取鼠形动物肺组织RNA, 用汉坦病毒检测试剂盒对样本进行检测, 阳性样本进行全基因组测序, 对序列进行相似性、遗传与变异等生物信息学分析。结果共捕获鼠形动物112只, 汉坦病毒阳性率为6.25%(7/112), 其中包括褐家鼠5只, 黄胸鼠2只;对阳性样本测序, 获得2条汉坦病毒的基因全序列(分别命名为:FJ35和FJ36, GenBank登录号:MW449188～MW449193), 全基因组序列均来自雄性褐家鼠;序列比对发现该样本所携带病毒属于汉坦病毒基因型汉城病毒(SEOV), 与山东省汉坦病毒分离株JX20140581和LZSF21之间核苷酸相似性较高为99%;采用最大似然法构建系统发育树发现该阳性样本所携带病毒属于S3亚型, 与浙江省、山东省以及东北地区汉坦病毒分离株Z37、LZSF21和zy27、Gongzhuling415等属于同一亚型;氨基酸序列分析发现, 与国际标准株SEOV80-39 M片段编码的氨基酸相比, FJ35和FJ36第81位谷氨酰胺(Q)变为精氨酸(R);与FJ372核蛋白氨基酸相比发现N259S变异。结论 2020年夏季宁德港鼠形动物汉坦病毒阳性率较高, 存在人群自然感染和流行的风险;形成该疫源地的病毒来自山东省某疫区的可能性比较大, 需要做好港口鼠形动物的输入性防控;2株阳性样本所携带病毒属于S3亚型, 与周围地区病毒株核苷酸及氨基酸同源性较高, 但糖蛋白及核蛋白氨基酸存在一些微小的变异, 可能引起相关抗原性的改变。

• 单位
  浙江省疾病预防控制中心; 江苏省人民医院