蛋白质功能预测任务旨在为缺失功能标签的蛋白质数据提供功能注释，随着蛋白质测序技术的发展，数据库中蛋白质数量迅速增长，由于蛋白质数据的复杂性和多元性，蛋白质功能预测任务极具挑战，受到研究人员的密切关注。梳理了机器学习在蛋白质功能预测中的发展历程；对近年来的蛋白质功能预测方法进行归类与总结，分析各类算法之间的异同；最后对蛋白质功能预测存在的问题进行讨论，并对该领域的未来研究进行展望。
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