摘要
LncRNA在真核生物中广泛转录,且响应于细胞外环境的变化.相比于mRNA,人们对lncRNA在DNA损伤应答中的作用了解甚少.基于高通量测序,本文系统地分析了裂殖酵母在4种DNA损伤药物(喜树碱、羟基脲、甲基磺酸甲酯和腐草霉素)处理下的lnc RNA表达谱.与m RNA相似,在DNA损伤环境下,lnc RNA的表达谱也发生了剧烈变化.161个受到4种药物共同诱导的lnc RNA及194个受到共同抑制的lnc RNA被定义为核心DNA损伤应答lnc RNA. Lnc RNA表达谱和m RNA表达谱之间的差异表明,lnc RNA在DNA损伤应答中起着重要功能,且这些功能可能并不依赖于调控邻近的m RNA.这项研究为进一步研究裂殖酵母中的lnc RNA在DNA损伤应答中的功能提供了基础和参考.
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