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摘要
本发明涉及一种基于显性表示蛋白口袋表层原子与配体相互作用满足程度的方法,该方法通过识别蛋白口袋表层原子与结合小分子和周围其它蛋白原子的相互作用关系,标记无关键相互作用的蛋白口袋表层原子和小分子原子生成可视化文件,并计算蛋白口袋表层原子的相互作用满足程度生成满足度列表。本发明通过标记无关键相互作用的蛋白口袋表层原子和小分子原子,可以较为清晰的观测到蛋白配体复合物中未有效发生结合作用的关键原子,从而有针对性的进行结构修改；通过计算蛋白口袋表层原子的满足度,便于找出未有效被满足的蛋白原子,有利于给出有方向性的结构修改意见。利用本发明,可以更直观有效的帮助药物分子有方向性的设计。
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