摘要
为分析lncRNA-MSTRG.13836.1的功能,确定杜泊羊毛囊周期性生长发育相关的关键靶向关系对,选择8只2周岁杜泊羊母羊作为研究对象,其中5只脱毛羊为试验组,另3只不脱毛羊为对照组。在3个时间点收集它们的皮肤样本并进行RNA测序(RNA-seq),通过lncRNA差异表达分析筛选关键lncRNA,并通过顺式和反式作用预测其靶基因,对靶基因进行功能分析,构建关键lncRNA的共表达网络,分析并筛选毛囊周期性生长发育相关的关键靶向关系对。结果表明,lncRNA-MSTRG.13836.1表达量在脱毛组和不脱毛组具有显著差异,其顺式和反式靶基因与雌激素信号通路相关。构建了lncRNA-MSTRG.13836.1的共表达网络并筛选到靶向4个miRNAs及5个与毛囊周期性生长发育相关的基因,这些基因在Wnt、TGF-β、PI3K-Akt及MAPK等与毛囊周期性生长发育密切相关的信号通路中起调控作用。综上,lncRNA-MSTRG.13836.1对绵羊毛囊周期性生长发育具有调控作用,lncRNA以及靶向的4个miRNAs (miR-214-z、miR-214-y、miR-9298-x、miR-11977-z)和5个基因(PTCH2、CTNNB1、FZD3、Lpar6、Wnt10b)可作为绵羊毛囊发育相关的关键调控因子。
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