由于水污染的特殊性,流域跨界水污染治理问题一直难以解决,现有的跨界水污染治理机制运作效果并不理想。本文认为我国跨界水污染治理是一个典型的复杂系统。以闽江流域为例,分析了水污染协同治理复杂系统的构成,并运用协同度模型测度了福州、三明和南平三个地市2011-2015年的闽江流域协同治理演化状态。结果显示闽江流域水污染协同治理系统的协同程度较低。完善利益激励机制,建立健全协调合作机制,深化监管机制有利于提高水污染协同治理系统的协同程度。