香蕉Aux/IAA基因家族密码子偏好性分析

作者：孙雪丽; 郝向阳; 李蓉; 项蕾蕾; 彭丽云; 刘范; 田娜; 程春振; 赖钟雄^*; 王天池^*

来源：分子植物育种, 2019, 17(08): 2467-2475.

DOI：10.13271/j.mpb.017.002467

• 香蕉
• Aux/IAA基因家族
• 密码子偏好性
• 基因功能研究

通过对香蕉Aux/IAA (auxin/indole-3-acetic acid)基因家族密码子使用偏好性进行研究为进一步的功能研究尤其是异源表达验证提供参考。本研究采用CodonW、EMBOSS在线程序、SPSS和Origin软件分析了香蕉Aux/IAA基因家族的密码子使用偏好性参数,并和香蕉基因组以及几种遗传转化再生体系成熟的模式植物基因组做了比较。结果表明:家族基因密码子偏好性较弱,偏好使用G或C,且以G或C结尾,与单子叶植物密码子偏好特性较为一致,UUG、GCA、GAC、GGA是该家族的最优密码子,具有偏好性的密码子和最优密码子与香蕉基因组差异较大。香蕉Aux/IAA基因家族密码子偏好性主要受突变压力影响。在密码子改造和优化的基础上,大肠杆菌原核表达系统适合作为该家族成员的异源表达系统,烟草可作为该家族基因遗传转化的受体。本研究结果有助于开展香蕉Aux/IAA基因家族的功能研究。

• 单位
  福建农林大学