核桃JrDREB基因家族鉴定及其响应冷胁迫基因的转录表达分析

作者：王辉; 彭佳丽; 孔德璇; 刘凯; 李瑶玲; 赵书岗^*

来源：分子植物育种, 2023, 1-20.

• 核桃
• DREB
• 冷胁迫
• 转录表达分析

DREB (dehydration responsive element binding protein)作为转录因子是一种干旱应答元件的结合蛋白，对植物的生长发育起着十分重要的调控作用。本研究在核桃全基因组挖掘DREB基因家族成员的基础上，对该家族成员进行了生物信息学分析，并结合核桃不同品种低温处理48 h后的转录组数据，以及不同组织的转录组数据，分析该家族基因在响应低温胁迫中的作用。结果表明：共获得65个DREB转录因子，基因长度为588～3 765 bp，编码的氨基酸为149～463 aa，等电点在4.72～9.48之间，分布在16条染色体上；系统发育分析表明DREB转录因子分为7个亚组(A1～A7)；核桃DREB基因家族的motif 1、motif 2和motif 4高度保守；冷害处理48 h后，根据转录组数据发现，65个核桃DREB基因家族成员的表达量均有差异，且在同种幼株的不同部位表达量也有所差异；对转录组数据筛选出的差异基因进行启动子分析以及蛋白质结构预测，推测JrDREB6、JrDREB55和JrDREB65 3个基因可能与核桃抵御冷害胁迫有关，且调控机制可能各不相同。本研究为核桃DREB基因家族成员在核桃植株中调控冷害胁迫的分子作用机制提供了理论支撑。

• 单位
  河北农业大学; 滨州职业学院; 生命科学学院