基于高通量测序的金钗石斛种子内生菌群落结构组成分析

作者：杨立昌; 吴庆珊; 高阳; 陈千权; 王玉倩; 牛晓娟; 翁庆北^*

来源：种子, 2020, 39(08): 94-98.

DOI：10.16590/j.cnki.1001-4705.2020.08.094

• 金钗石斛
• 种子
• 高通量测序
• 内生细菌
• 内生真菌
• 多样性

本研究基于免培养和高通量测序技术,对金钗石斛种子内生菌16 S rDNA V 4区和ITS 1区扩增序列进行分析,揭示内生菌的组成和丰度。结果表明:扩增的内生细菌16 S rDNA序列归为13 OTUs,隶属于变形菌门(Proteobacteria)和蓝细菌门(Cyanobacteria);其中变形菌门为优势门,泛菌属(Pantoea)为优势属;香农指数、辛普森指数和Chao 1指数分别为1.82、0.69和11.00。内生真菌序列归为14个OTUs,隶属于子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)和接合菌门(Zygomycota);其中子囊菌门为优势门,德巴利酵母属(Debaryomyces)为优势属;香农指数、辛普森指数和Chao1指数分别为0.57、0.79和14.13。金钗石斛种子的内生细菌与内生真菌具有一定的多样性。此研究为进一步促进金钗石斛种子萌发及幼苗栽培具有一定的指导意义。

• 单位
  贵州师范大学; 生命科学学院