霍乱弧菌H2C全基因组测序及序列分析

作者：温娟; 张建梅; 陈泽辉; 沈惠燕; 张荣秋^*

来源：中国卫生检验杂志, 2022, 32(15): 1807-1810.

• 霍乱弧菌
• 全基因组测序
• 基因功能
• 毒力基因

目的 了解霍乱弧菌产毒株的基因序列，为霍乱基因组学研究提供资料，对可能发生的公共卫生突发事件提供保障。方法 利用Illumina Hiseq测序平台对1株霍乱弧菌（Vibrio cholerae）H2C进行了全基因组测序，对基因组进行组装、基因预测和功能注释。结果 H2C基因组大小为4.09 Mb,GC含量为47.34%，预测编码基因3 642个。在H2C基因组中注释到3 252个基因具有直系同源蛋白簇分类，共查到111个tRNA和9个rRNA基因。与代谢通路相关基因2 366个，与毒力相关基因417个。通过KEGG定位到RTX、CTX和TCP毒力相关基因簇。结论 霍乱弧菌H2C携带多种毒力相关基因，对该菌致病性及环境适应性起到关键作用。

• 单位
  厦门市疾病预防控制中心