黄萎病不同抗性陆地棉品种抗病基因同源序列生物信息学分析

作者：简桂良; 赵磊; 张文蔚; 齐放军; 王升正

来源：棉花学报, 2011, (06): 490-499.

• 棉花
• 抗病基因同源序列(RGA)
• 核苷酸结合位点(NBS)
• 生物信息学分析
• 多态性 Gossypium hirsutum
• resistance gene analog(RGA)
• nucleotide-binding sites(NBS)
• analysis
• polymorphism

根据已知抗病基因NBS(Nucleotide-binding sites)保守区的P-loop和GLPL区设计一对简并引物F1/R1,以已鉴定黄萎病抗性的9个陆地棉品种基因组DNA为模板进行PCR扩增。在9个品种中均扩增出500 bp左右的条带。对目的条带进行回收,连接、转化克隆得到350个阳性克隆,进行测序。在8个棉花品种中克隆到74条具有完整开放读码框的棉花RGAs序列。这74条序列共有64种不同的基因型,有10条与其它品种中的RGAs序列相同。用MEGA软件对8个棉花品种的74条RGA序列以及12个已知的抗病基因的NBS区域进行聚类分析,结果分为TIR和nonTIR两大类,而nonTIR...

• 单位
  植物病虫害生物学国家重点实验室; 中国农业科学院植物保护研究所