辣椒GRAS家族全基因组鉴定与表达分析

作者：张焕欣; 董春娟; 尚庆茂

来源：园艺学报, 2017, 44(12): 2305-2317.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2017-0132

• 辣椒
• GRAS基因家族
• 进化分析
• 表达特性

基于辣椒全基因组数据信息,利用生物信息学方法对CaGRAS基因家族进行了系统鉴定和进化分析,并通过Real-time PCR方法检测了CaGRAS家族组织表达模式和对PEG6000、盐胁迫的应答。结果表明:在辣椒中存在54个CaGRAS基因,除11号染色体外其余染色体均有分布,外显子数13,等电点4.979.13;系统进化分析显示CaGRAS基因可分为8个进化群;CaGRAS基因具有不同的表达模式,在根、茎、叶片和茎尖中优势表达的基因分别有34、8、3和8个;多数CaGRAS基因能响应PEG6000和盐胁迫,其中CaGRAS11、CaGRAS30、CaGRAS40、CaGRAS44和CaGRAS50受到PEG6000和盐胁迫的强烈诱导。本研究为深入解析CaGRAS家族基因的功能奠定了一定基础。

• 单位
  中国农业科学院蔬菜花卉研究所; 农业部