大理地区HIV相关鸟结核分枝杆菌MLVA基因分型研究

作者：翟凯新; 刘丽婷; 陈晓文; 陈越; 高婧华; 吴利先^*

来源：中国病原生物学杂志, 2020, 15(08): 929-933.

DOI：10.13350/j.cjpb.200812

• 鸟分枝杆菌
• 菌种鉴定
• 非结核分枝杆菌
• 可变串联重复序列
• 药敏试验

目的对云南大理地区HIV相关的12株非结核分枝杆菌(non-Tuberculous mycobacteria,NTM)进行鉴定,了解其菌种构成;探讨MLVA法在大理地区HIV相关鸟分枝杆菌(Mycobacterium avium,MAV)基因分型的应用,了解MAV基因型特征和耐药情况。方法对初步鉴定的NTM通过16SrRNA、hsp65和rpoB靶基因片段测序分析进行菌种鉴定;对鉴定后的HIV相关MAV进行MLVA基因分型。采用MLVA法选取15个数目可变串联重复序列(VNTR)特异位点,运用聚合酶链反应(PCR)和琼脂糖凝胶电泳技术检测MAV的DNA指纹图谱。运用Quantity One和BioNumerics(6.6)软件对结果进行数字化处理,采用UPGMA法和MST法进行聚类分析;通过比例法对HIV相关MAV进行6种二线抗结核药物的药敏试验。结果大理地区12株HIV相关NTM中,9株为MAV,1株为帕拉分枝杆菌,1株为戈登菌,1株为脓肿分枝杆菌。9株HIV相关MAV通过MLVA法进行基因分型,15个VNTR位点呈多态性,不同位点的HGDI值存在差异,其中MATR-14为0.75,MATR-14、MATR-9等13个位点均≥0.5。9株双感MAV经UPGMA法聚类分析分为3个基因群、8个基因型,用MST法聚类分析则分为3个簇;HIV相关MAV对丙硫异烟胺(TH1321)均敏感,阿米卡星(AK)耐药率为100%(9/9),左氧氟沙星(LFX)耐药率为77.8%(7/9),莫西沙星(MFX)耐药率为66.7%(6/9),卷曲霉素(CPM)耐药率为55.6%(5/9),利福布丁(RBU)耐药率为11.1%(1/9)。结论大理地区12株HIV相关NTM分为MAV、帕拉分枝杆菌和戈登菌,其中以MAV占多数。MATR-VNTR分析,不同MAV菌株同一位点的基因片段差异明显,有多态性。MATR-14、MATR-9等13个位点分辨力高,可作为大理地区HIV相关MAV的基因分型首选位点;MAV对丙硫异烟胺(TH1321)敏感,对阿米卡星耐药率高,而且出现多药耐药。

• 单位
  基础医学院; 大理大学