生物信息学技术筛选乳腺癌他莫昔芬耐药关键基因及相关通路分析

作者：李雷雷; 徐文漭; 王光辉; 杨举伦^*

来源：临床与实验病理学杂志, 2022, 38(08): 977-981.

DOI：10.13315/j.cnki.cjcep.2022.08.017

• 乳腺肿瘤
• 生物信息学分析
• 他莫昔芬耐药
• 差异基因

目的 应用生物信息学技术筛选乳腺癌他莫昔芬耐药关键基因并分析相关通路，为预测乳腺癌潜在治疗靶点奠定基础。方法 选取NCBI-基因表达综合数据库(GEO)中的基因表达芯片“GSE67916”和“GSE96670”,利用GEO2R在线分析工具对乳腺癌他莫昔芬耐药样本和敏感样本中的差异基因进行筛选。利用DAVID和KOBAS在线工具对差异基因进行GO分析和KEGG分析。使用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析STRING数据库构建靶点互作网络模型。结果 筛选了132个差异基因，包括103个上调基因和29个下调基因，通过Cytoscape确定4个关键基因：IFI27、IRF9、OAS1、ISG15。GO分析显示差异基因主要参与细胞黏附、细胞质外泌体、蛋白结合功能。KEGG分析显示差异基因主要参与内吞作用、癌蛋白多糖、雌激素信号通路。结论 乳腺癌他莫昔芬耐药与IFI27、IRF9、OAS1、ISG15有关，其可作为乳腺癌治疗的潜在靶点。

• 单位
  贵州省人民医院; 昆明医科大学