鲍曼不动杆菌感染HeLa细胞与YY1互作的差异蛋白鉴定

作者：丁文一; 安志远^*

来源：生物技术, 2023, 33(01): 9-13.

DOI：10.16519/j.cnki.1004-311x.2023.01.0002

• 鲍曼不动杆菌
• 转录因子YY1
• Co-IP/MS技术
• HeLa细胞
• 生信分析

[目的]鉴定鲍曼不动杆菌感染HeLa细胞前后与YY1互作的差异蛋白。[方法]用脂质体转染法在HeLa细胞中过表达YY1;之后用Co-IP技术捕获与YY1相互作用的蛋白质；最后利用高效液相色谱质谱联用技术鉴定互作差异蛋白。用GO注释和KEGG分析预测蛋白质的功能。[结果]经Co-IP和蛋白银染发现鲍曼不动杆菌感染组和YY1捕获组与IgG组比较在45～55 kDa和70～100 kDa处有明显的差异条带；质谱结果显示YY1捕获组的特有蛋白有81个，GO注释和KEGG分析表明这些差异蛋白定位于细胞核及核膜，具有RNA结合功能，主要参与了RNA剪切的生物学过程；与IgG组和YY1捕获组比较在鲍曼不动杆菌感染组中获得了SFRS4、CPSF2、LUC7L2和U2AF65这些差异蛋白。GO注释和KEGG分析表明这些差异蛋白定位于细胞核散斑，具有RNA结合功能，主要参与了mRNA剪切和核输出的生物学过程。[结论]鲍曼不动杆菌感染的HeLa细胞中与YY1作用的蛋白均参与了RNA剪切过程，提示鲍曼不动杆菌很可能利用这些蛋白来调节YY1,为进一步研究鲍曼不动杆菌与YY1的相互作用机制奠定了基础。

• 单位
  中国医学科学院北京协和医院; 首都医科大学附属北京朝阳医院