镧对铜胁迫下水稻转录组模式的调控分析

作者：仲雨晴; 陈佳佳^*

来源：生物技术通报, 2020, 36(08): 8-14.

DOI：10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2020-0110

• 水稻
• 转录组
• 铜胁迫
• 镧
• 测序

探究稀土镧对铜胁迫下水稻转录组的影响,鉴定镧在调控水稻铜胁迫应答中的关键基因和功能。利用抗氧化酶活性筛选最适铜胁迫及镧处理浓度,进行转录组测序和差异表达分析,并用qRT-PCR验证差异表达水平。对测序数据进行差异表达分析发现3 222个基因显著上调,3 798个显著下调,qRT-PCR验证了4个细胞壁防御相关基因CHIT13、Laccase、Expansin和GH3.4。功能和通路分析获得95组GO条目和112条KEGG通路,富集于激酶和氧分子结合等分子功能、细胞壁及质膜等细胞组分、次级代谢和脂质代谢等生物学过程以及苯丙烷生物合成和植物激素信号转导通路。镧通过调节细胞壁形成和组分提高水稻铜胁迫耐受性。

• 单位
  苏州科技大学