CIP2A在不同肝病组织中表达及其协同表达基因的生物信息学分析

作者：杨雪; 张靖; 韩少山; 陶杰; 孙昊; **光

来源：新疆医科大学学报, 2019, 42(06): 728-733.

• CIP2A
• 肝炎
• 肝硬化
• 肝癌
• 计算机生物学

目的分析蛋白磷酸酶的癌性抑制因子(CIP2A)在不同肝病组织中表达,探索CIP2A协同表达基因网络中的潜在干预靶点。方法采用组织芯片免疫组织化学染色明确CIP2A在不同肝病组织中的表达,应用权重基因共表达网络分析(WGCNA),探索CIP2A基因同肝细胞癌差异表达基因的基因模块之间的关系,在DAVID数据库中进行相关功能富集分析及信号转导通路富集分析。结果组织芯片上60例肝细胞癌组织标本中,49例肝癌组织中CIP2A蛋白表达阳性或强阳性,阳性率为81.67%,7例肝硬化组织标本中有2例间质纤维明显增生的肝组织,可见CIP2A蛋白在肝细胞胞浆中存在弱阳性表达,阳性率为28.56%,而5例正常肝脏组织、8例慢性活动性肝炎组织标本中均未见CIP2A蛋白阳性表达。肝癌组织中CIP2A阳性率表达率明显高于肝硬化组织、慢性活动性肝炎组织及正常肝组织,差异有统计学意义(P0.4。KEGG通路富集分析结果提示,与CIP2A密切相关基因集中在3条信号通路,包括细胞周期、DNA复制及p53信号通路。GO生物学功能通路富集分析显示,与CIP2A密切相关基因主要集中在15种生物学功能通路,包括细胞分裂、核有丝分裂、DNA复制等。结论 CIP2A与肝癌的发生发展密切相关,涉及多个生物学过程和信号转导通路。

• 单位
  西安交通大学第一附属医院; 陕西省肿瘤医院