炭疽芽胞杆菌中CRISPR位点

作者：高志奇; 王东澍; 冯尔玲; 王秉翔; 惠一鸣; 韩少波; 焦磊; 刘先凯; 王恒樑

来源：微生物学报, 2014, 54(11): 1362-1368.

DOI：10.13343/j.cnki.wsxb.2014.11.014

• 规律成簇间隔短回文重复序列
• 炭疽芽胞杆菌
• 分子分型

【目的】考察炭疽芽胞杆菌中规律成簇的间隔短回文序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)位点多态性情况及基于CRISPR位点多态性的分子分型方法是否在炭疽芽胞杆菌分型中适用。【方法】下载NCBI数据库中6株炭疽芽胞杆菌基因组并截取其中CRISPR位点片段序列。根据炭疽芽胞杆菌内CRISPR位点信息,设计相关引物,以193株炭疽芽胞杆菌基因组为模板PCR扩增CRISPR位点片段,测序。本地Blast比对截取序列及测序结果,查看CRISPR位点在炭疽芽胞杆菌中的多态性情况,并比较炭疽芽胞杆菌与蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌内CRISPR位点情况。【结果】炭疽芽胞杆菌内CRISPR位点不存在多态性。【结论】基于CRISPR位点多态性的分子分型方法不适用于炭疽芽胞杆菌分型,但可以用于区分炭疽芽胞杆菌与蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌。

• 单位
  病原微生物生物安全国家重点实验室; 军事医学科学院; 兰州生物制品研究所有限责任公司