甘蓝型油菜BnaC.RECQ4B基因的生物信息学与组织表达分析

作者：丁鹏; 高月; 谭小力; 朱克明^*

来源：江苏农业科学, 2023, 51(12): 57-64.

DOI：10.15889/j.issn.1002-1302.2023.12.007

• 甘蓝型油菜
• RECQ解旋酶
• 生物信息学
• 克隆
• 基因表达量

RECQ解旋酶是机体分子代谢途径中重要的调控蛋白，本研究为了探究甘蓝型油菜减数分裂中解旋酶RECQ的功能及其表达模式。首先，运用RT-PCR技术克隆获得1个甘蓝型油菜RECQ基因，并命名为BnaC.RECQ4B,运用PCR技术克隆获得BnaC.RECQ4B的启动子序列，命名为Pro.BnaC.RECQ4B;并对该基因编码的蛋白以及启动子序列进行生物信息学分析；最后，运用qRT-PCR技术对甘蓝型油菜不同组织进行基因表达量分析。结果表明，BnaC.RECQ4B开放阅读框(ORF)长度为3 477 bp,编码1 158个氨基酸，分子质量为18 086 u,等电点为8.38,属于亲水性不稳定碱性蛋白，可能是非分泌蛋白，蛋白质二级和三级结构显示无规则卷曲和α-螺旋所占比例较高，BnaC.RECQ4B与拟南芥的氨基酸序列相似性达到74%,该基因启动子不仅包含多种响应逆境胁迫的顺式元件，还包含大量的光反应与光响应相关调控元件，BnaC.RECQ4B在花苞、花中表达量较高，分别是根中的11.94、11.19倍；在叶、茎、角果中也有较高表达，分别是根中的10.50、4.73、5.93倍。上述结果初步表明，BnaC.RECQ4B具有解旋酶功能，可能参与植物体的DNA损伤修复等功能，为进一步探讨甘蓝型油菜BnaC.RECQ4B基因表达调控及作用机制提供了理论支持与实践基础。

• 单位
  生命科学学院; 江苏大学