过敏性紫癜关键基因的生物信息学分析及中药治疗预测

作者：罗斐; 袁颢宸; 刁娟娟^*

来源：激光生物学报, 2022, 31(02): 165-172.

• 过敏性紫癜
• 生物信息学
• 差异miRNA基因
• hsa-miR-3945
• 中药预测

通过生物信息学对过敏性紫癜（HSP）的差异表达miRNA进行分析，探索其调控的基因、生物过程及代谢通路，进而预测治疗HSP的潜在中药组方。运用GEO数据库对原始数据集GSE80401进行差异分析，筛选出差异表达的miRNA，通过miRwalk、TargetScan、miRDB数据库预测靶基因，基于Metascape数据库进行基因本体（GO）和pathway富集分析，利用Cytoscape软件进行关键靶点筛选。最后将关键靶点与Coremine Medical数据库相互映射，筛选治疗HSP的潜在中药组方。基于GSE样本数据预测的靶基因共有83个，关键基因为hsa-miR-3945,GO富集分析结果涉及对脂多糖的反应、对无机物的反应、凋亡信号通路、对细胞外刺激的反应等生物过程，KEGG富集结果涉及IL-17信号通路、TNF信号通路、Th17细胞分化通路、NF-κB信号通路等。中药预测发现桂枝、茯苓、赤芍、桃仁、牡丹皮可作为潜在药物来治疗HSP。显著性差异基因和潜在核心靶点的分析研究促进了对HSP发病机制的进一步理解和探索，为中医药治疗HSP提供了新的方向和临床依据。

• 单位
  山东中医药大学附属医院; 第一临床医学院; 山东中医药大学