创伤弧菌毒力相关因子的全基因组关联分析研究

作者：张嘉鑫; 武雅蓉; 杨超; 康琳; 王景林^*; 崔玉军^*

来源：微生物学报, 2020, 60(07): 1488-1495.

DOI：10.13343/j.cnki.wsxb.20190628

• 创伤弧菌
• 全基因组测序
• 全基因组关联研究
• 毒力因子

【目的】创伤弧菌是致死率最高的弧菌物种,但目前尚无在全基因组层面挖掘毒力相关因子的研究。本研究以创伤弧菌分离来源(临床和环境)作为不同表型,通过与260株基因组序列进行关联分析,挖掘毒力相关因子,从而进一步了解创伤弧菌致病因素。【方法】对139株创伤弧菌分离株进行高通量测序,获取其全基因组序列;与公共数据库已公开发表的121株基因组整合,使用pyseer软件进行全基因组关联分析,对与不同分离来源显著相关的基因进行注释和解读。【结果】共发现11个基因与临床分离株显著相关,其中9个是本研究新发现的创伤弧菌潜在毒力相关因子。【结论】本研究使用群体基因组学和统计遗传学方法,在全基因组范围扫描挖掘了创伤弧菌毒力相关因子,为深入揭示该物种致病机制、设计新的疫苗和治疗靶点提供了重要依据。

• 单位
  安徽医科大学; 病原微生物生物安全国家重点实验室