云南省鹤庆县2017年分离鼠疫菌分子溯源

作者：石丽媛; 丁奕博; 谭红丽; 郭英; 张海鹏; 段存娟; 李伟^*; 王鹏^*

来源：中华流行病学杂志, 2018, 39(07): 983-987.

DOI：10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2018.07.022

• 鼠疫
• 鹤庆县
• 多位点可变数目串联重复序列分析

目的了解2017年云南省鹤庆县新分离的鼠疫菌的基因分型, 为该地的鼠疫防控提供科学依据。方法采用差异片段(DFR)、规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPRs)和多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)3种方法对10株鹤庆县新分离鼠疫菌进行分型, 并将10株鼠疫菌及邻近疫源地鼠疫菌株93株纳入聚类分析。结果鹤庆鼠疫菌株与丽江鼠疫疫源地菌株具有相同的DFR型(Genomovar 05型)及CRISPRs型(Ca7簇, 22型), 在MLVA聚类分析中, 鹤庆鼠疫菌株与丽江野鼠鼠疫菌株位于同一个簇, 两者之间仅有2个位点(N2117, M23)的差异。结论 2017年云南省鹤庆鼠疫菌株与丽江野鼠鼠疫疫源地菌株具有很高的同源性, 鹤庆县疫情可能是丽江鼠疫进一步向南扩散的结果。

• 单位
  传染病预防控制国家重点实验室; 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所; 云南省地方病防治所