本发明属于生物催化及生物制造领域,公开了一种可控合成呋喃羧酸的方法,具体是用特定的酶耦合氧化型辅酶再生体系在相应的水溶液中催化5-羟甲基糠醛选择性氧化合成5-羟甲基-2-糠酸、5-甲酰基-2-糠酸和2,5-呋喃二甲酸。本发明具有反应条件温和、选择性高、反应过程简单、环境友好、辅酶转化系数高和生产成本低等优点;涉及到的氧化型辅酶再生体系具有效率高、兼容性好,能在工业反应条件应用等特点。