基于高通量测序的两种典型忽地笑栽培土壤根际真菌群落多样性

作者：全妙华^*; 佘朝文; 陈东明; 胡朝暾; 赵丽娟

来源：微生物学通报, 2018, 45(10): 2105-2111.

DOI：10.13344/j.microbiol.china.180337

• 中药材
• 根际土壤
• 真菌
• 高通量测序
• 遗传多样性

【背景】忽地笑为传统中药材,可用于治疗老年性痴呆症、重症肌无力等疾病,具有重要的药用价值。腐殖土(壤土)适宜忽地笑的生长与栽培,黄棕壤(粘性土)对其生长不利。根际微生物可促进或抑制植物生长,直接影响药用植物产量和有效成分含量的变化,因此近年来对药用植物与根际微生物关系的研究得到了高度重视。【目的】通过2种栽培土壤根际真菌的群落结构及多样性研究,旨在探讨根际真菌对忽地笑生长发育的影响。【方法】提取土壤总DNA,采用高通量测序及生物信息统计分析等方法进行研究。【结果】腐殖土和黄棕壤分别获得真菌ITS1序列42 130和30 176条;腐殖土和黄棕壤根际真菌类群分别划分为6门25纲61目123科208属和5门20纲48目85科138属,最优势门类均为子囊菌Ascomycota (相对丰度>70%),但主要优势属及多样性指数等存在较大差异,其中腐殖土的主要优势类群有Ascomycotaunclassified、Fusarium、Zopfiella、Chaetomiaceaeunclassified、Ceratobasidium、Mortierella等,而黄棕壤的主要优势类群为Sordariomycetesunclassified、 Fusarium、 Acremonium、 Rhizoctonia、Nectriaceaeunclassified、Hymenoscyphus等;通过SPSS统计软件分析表明,腐殖土的Ascomycotaunclassified、Zopfiella、Ceratobasidium、Mortierella等优势类群与忽地笑鳞茎中石蒜碱含量之间呈极显著正相关性。【结论】适宜栽培忽地笑的腐殖土根际真菌的遗传多样性比黄棕壤更丰富;腐殖土根际主要优势类群Ascomycotaunclassified、Zopfiella、Ceratobasidium等可能有利于忽地笑生长发育及其石蒜碱等生物碱积累。

• 单位
  怀化学院