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摘要
本研究从四倍体野生种花生中分离了Ty3-gypsy类反转录转座子的反转录酶(RT)基因序列，分析了其序列特点和差异，为研究其转录活性和功能奠定基础。根据Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的保守区设计简并引物，PCR扩增四倍体野生种花生“Arachis monticola” (PI468199)的DNA，目的条带经回收、克隆和测序后，进行生物信息学分析。结果显示，目的条带大小约为430 bp，共有29条AmRT2-X基因序列被分离出，这些序列长度变化范围为397～433 bp，AT所占比例范围为55.66%～65.97%，核苷酸序列间相似性在45.1%～97.2%之间，存在较高异质性；29条AmRT2-X基因序列被聚类划分为8个家族，家族A是包含序列最多的家族；翻译成氨基酸后，有10条AmRT2-X基因序列发生了无义突变；氨基酸序列间相似性在22.3%～98.6%之间，呈现高度异质性；绝大部分AmRT2-X基因序列的保守基序一致；系统进化树显示，所有RT基因序列被分为6类，其中，Ⅰ类包含20条AmRT2-X基因序列，Ⅱ类中的4条AmRT2-X基因序列与来自拟南芥、多花黑麦草、火龙果、牡丹、果梅、枣、山桑、白皮松等物种植物的序列之间亲缘关系较近；通过比对花生EST数据库，发现2条具有转录活性的四倍体野生种花生Ty3-gypsy类反转录转座子。本研究为Ty3-gypsy类反转录转座子全长序列的分离及其功能的研究奠定一定基础。
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