河北省保定市HIV-1流行重组毒株基因分布特征及独特重组毒株重组结构分析

作者：李艳; 刘洋; 赵煊赫; 赵静; 杨学刚; 安伟娜; 李永勤^*

来源：中国皮肤性病学杂志, 2023, 37(01): 82-87.

DOI：10.13735/j.cjdv.1001-7089.202205030

• HIV-1
• 流行重组毒株
• 独特重组毒株

目的 了解河北省保定市2019年6月-2021年12月HIV-1流行重组毒株基因分布特征及独特重组毒株重组结构。方法 使用自建的方法扩增HIV-1 pol区全长基因并测序，然后使用系统进化分析鉴定HIV-1亚型。对不能明确分型的标本利用近末端稀释法分两段进行HIV-1近似全长基因组的扩增。测序结果使用Sequencher 5.4.6软件进行序列拼接，使用Bioedit进行序列的比对和处理，SimPlot工具进行序列相似性分析，并利用Bootscan工具进行重组断点分析，最后使用在线工具Recombinant HIV Drawing Tool绘制重组镶嵌图谱，分析保定市HIV-1独特型重组毒株的重组结构。结果 共获得296份样本的264条HIV-1 pol区全长基因序列片段(3.1kb)。HIV-1主要亚型为CRF01＿AE(51.89%, 137/264)、CRF07＿BC(25.00%, 66/264)和B亚型(10.98%, 29/264)。流行重组毒株(CRFs)占85.61%(226/264),独特重组毒株(URFs)流行率为3.41%(9/264)。对其中9例URFs中的5例成功进行了近乎全长基因序列扩增并测序，均为URFs,其中1例是01B的URF,4例是0107的URF。结论 保定市HIV-1重组毒株(包括CRFs和URFs)的流行率达到了89.02%,并出现了较高比例的新型独特重组毒株，应密切监测其流行趋势，采取相应的措施加以干预。