芸薹属物种(B.napus,B.rapa,B.oleracea)PHB基因的生物信息学分析

作者：王晗^*; 闫敏; 许晔; 王仁雷; 刘少华

来源：分子植物育种, 2021, 19(13): 4232-4241.

DOI：10.13271/j.mpb.019.004232

• 芸薹属
• PHB
• miR165,miR166
• 生物信息学

HD-ZIPⅢ基因家族参与植物胚胎发生、分生组织形成、叶极性建立和维管组织分化等过程。本研究利用生物信息学方法,对HD-ZIPⅢ成员之一PHABULOSA (PHB)进行鉴定,在甘蓝型油菜、白菜和甘蓝中共获得7个PHB成员,并对其核苷酸和氨基酸序列的基本特征、结构域、保守基序、基因结构和系统进化关系进行了分析。结果表明,这些PHB蛋白编码不稳定的亲水性蛋白,所有成员均含有Homeobox、bZIP、START和MEKHLA保守结构域,PHB位点在三个物种间的进化符合禹氏三角理论。序列分析及测序结果显示白菜的两个PHB基因在miR165、miR166结合位点处存在一个碱基差异。本研究为进一步揭示芸薹属物种PHB基因功能提供了依据。

• 单位
  化学化工学院; 江苏第二师范学院; 江苏省生物功能分子重点建设实验室