基于SNP标记的观赏向日葵种质资源遗传多样性分析

作者：刘继霞; 山军建; 王平

来源：分子植物育种, 2022, 1-18.

• 观赏向日葵
• 种质资源
• SNP标记
• 遗传多样性

为了提高观赏向日葵种质资源利用效率，挖掘优异的观赏向日葵种质资源，本研究对49份不同类型观赏向日葵保持性材料10个表型性状进行调查分析，并利用简化基因组测序技术SLAF-seq对观赏向日葵种质资源进行遗传多样性研究。结果表明：表型性状变异系数在（16.82%～56.62%）之间，平均变异系数为30.23%，平均多样性指数1.34%，其中数量性状平均多样性指数1.83%，质量性状平均多样性指数0.85%，说明收集的观赏向日葵种质资源的表型多样性较为丰富，优良的种质资源丰富，有利于育种程序中选育优质的观赏向日葵品种。利用SLAF-seq测序技术进行测序，产出数据共21.3G，各样品所获得的读长数目在1 411 504～3 129 308范围内，其中MAF值大于0.05的位点有28 531个，获得可信度的SNP位点34 005个。基于观赏向日葵资源10个表型性状与SNP的聚类分析结果均将49份观赏向日葵种质资源划分为2类，及通过群体结构和PCA分析也分为2组，说明所选的种质资源表型上存在变异，群体内部存在较高遗传多样性水平。本研究对观赏向日葵种质改良与优质品种选育提供理论依据。

• 单位
  宁夏农林科学院农作物研究所