基于热溶解膜过滤法的太岁古菌菌群结构研究

作者：王朝江^*; 王世清; 李慧; 信艳杰; 高春燕

来源：生命科学研究, 2021, 25(04): 355-362.

DOI：10.16605/j.cnki.1007-7847.2020.07.0216

• 太岁
• 热溶解膜过滤法
• 古菌结构
• 甲烷杆菌属

为获知太岁中古菌准确的菌群结构及分析其与原有结果的不同,在太岁组织表里层不同位置重复取样,采用适合太岁材料特性的热溶解膜过滤法处理后提取DNA,随后利用Illumina Mi Seq高通量测序平台测定古菌16S r DNA V3～V4区扩增序列。结果显示:供试太岁所含古菌分属16个门、27个纲、39个目、64个属,相对丰度大于0.01%的属有22个;表层的多样性高于里层,由外至内有物种消失现象;重复取样间存在大量非共有菌群;甲烷杆菌属(Methanobacterium)是有高丰度OTU支撑的优势菌群,相对丰度在43.859 5%～96.811 0%,是用常规方法提取DNA测知的优势属中,唯一仍保持优势地位的属,且在内部样品中的相对丰度较之前测定值分别提升39.554 2%和65.924 4%。上述结果表明,甲烷杆菌属是太岁所含古菌的优势菌群,在其形成中存在作用。

• 单位
  河北省农林科学院遗传生理研究所