本发明提供一种创新生态系统成员的选择方法和系统,涉及数据处理领域。该方法包括:包括:构建创新生态系统的理论框架;获取原始数据;通过预选的fsQCA软件对所述原始数据进行处理,得到多条成员成功选择路径;判断目标企业包含的全部评价因素是否符合任一条成员成功选择路径,若是,则将目标企业作为创新生态系统成员。基于上述处理,不仅可以快速地确定目标企业是否可以作为创新生态系统成员,而且通过多个评价因素的比较,可以有效提升创新生态系统成员选择结果的准确度。