基于SLAF-seq玉米高密度遗传连锁图谱构建与株型性状QTL定位

作者：薛春雷; 吴慧; 逯晓萍^*; 韩平安; 孙峰成; 张来厚

来源：科技导报（北京）, 2021, 39(14): 144-154.

• 玉米
• SLAF-seq技术
• 高通量测序
• 高密度遗传连锁图谱
• 株型

株型直接决定生物产量、种植密度与籽粒产量,利用玉米高密度遗传连锁图谱解析株型相关性状的遗传机制,对选育理想株型玉米新品种具有重要意义。本研究利用SLAF-seq技术,依据玉米黄早四参考基因组信息,对昌7-2与PHB1M及其138个F2∶3家系高通量测序,开发高密度SNP的遗传图谱,并进行株型相关性状QTL定位。研究结果构建了一张总图距为1354.81 c M,标记间的平均距离为0.32 c M,标记数为4220个SLAF标签(7876个SNP)的高密度遗传图谱。在E1与E2两种密度下,对株高、穗位、叶片数、节间数、平均节间长进行QTL定位,共检测到10个QTL位点,其中,有7个PVE超过了10%。叶片数、穗位、节间数为主效QTL,ADD为负值,叶片数与节间数的减效等位基因来源于PHB1M,穗位的减效等位基因来源于昌7-2。叶片数与节间数在2个密度下均定位在8号染色体上,说明二者之间有着共同的遗传机制。与QTL关联的SLAF标记共有61个,其中,SLFA7305498和SLFA6717271为q LC-2-LG8与q IC-2-LG8共有标记。该研究将为玉米株型相关性状的标记辅助选择提供支撑。

• 单位
  内蒙古农业大学; 内蒙古自治区农牧业科学院