摘要
紫叶李是一种具有较高观赏价值的落叶乔木,叶色是紫叶李重要的观赏性状之一。为探究影响紫叶李花色素苷合成的关键酶基因,本研究应用Illumina NovaSeq6000测序平台,对性状分别为红叶、绿叶和普通叶的紫叶李进行了转录组测序。实验以红叶紫叶李为实验组,绿叶和普通叶分别作对照组,每个样品各3个生物学重复,共获得195 548 106条clean reads。通过对差异表达基因分析,筛选到红叶相对绿叶的差异表达基因5 376个,其中上调表达基因2 686个,下调表达基因2 690个;红叶相对普通叶的差异表达基因6 197个,其中上调表达基因3 193个,下调表达基因3 004个。通过GO功能分类,可分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类,其中红叶紫叶李和绿叶紫叶李比对注释到44个功能组,红叶紫叶李和普通叶紫叶李比对注释到47个功能组。通过代谢通路KEGG pathway分析表明,红叶紫叶李和绿叶紫叶李比对有897个差异表达基因参与了120条已知的代谢通路,红叶紫叶李和普通叶紫叶李比对有1 108个差异表达基因参与了121条已知的代谢通路,其中苯丙素合成通路、类黄酮合成通路及黄酮和黄酮醇合成通路三条花色素苷相关代谢通路的部分基因表达存在显著的差异,并通过实时荧光定量,验证花色素苷合成相关差异表达基因在三种不同叶色紫叶李中的表达模式。本研究丰富了紫叶李的转录组信息,为进一步揭示紫叶李叶片着色的相关分子机制、生长相关基因克隆和表达等研究提供科学依据。
- 单位