TIPIN:肝癌预后生物标志物

作者：李姝婧; 刘怀峰; 王香港; 王清晴; 陈玉欣; 石兵兵; 谭静文; 王媛媛^*

来源：安徽科技学院学报, 2022, 36(03): 52-59.

DOI：10.19608/j.cnki.1673-8772.2022.0010

• TIPIN
• 肝癌
• 生物信息学分析
• 预后标志物

目的:通过生物信息学方法分析TIPIN基因在肝癌中的表达及其作用。方法:通过癌症与肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中下载肝癌的mRNA表达数据，分析TIPIN表达与临床病理参数的关系。利用Rstudio软件中limma、survival、ROC等R包进行数据整理、基因表达量分析、生存分析、COX分析以及ROC分析，并通过基因集富集分析(GSEA)鉴定与TIPIN表达相关的信号通路。利用cBioportal数据库进行数据挖掘，筛选与TIPIN相互作用的基因。结果:与正常肝组织相比较，TIPIN基因在肝癌组织中的表达量显著升高，且TIPIN低表达的患者生存率较高，而高表达患者生存率显著降低。TIPIN的表达量与临床分期显著相关，与总生存期独立相关。TIPIN高表达样本中，膀胱癌、非小细胞性肺癌、DNA复制信号通路、NOTCH信号通路、P53信号通路和WNT信号通路等肿瘤相关信号通路显著富集。基因共表达分析显示FANCI与TIPIN显著正相关，且和TIPIN一致，FANCI在肝癌组织中高表达且FANCI高表达患者生存率显著降低。结论:TIPIN的表达促进了肝癌的发生与发展，可以作为肝癌诊断和预后的生物标志物。

• 单位
  生命科学学院; 蚌埠医学院