摘要

鱼类肌肉形成和生长性状相关因素是水生生物学和水产养殖领域的热点问题。鱼类肌肉组成型基因的表达调控是其组织形成及功能维持的关键,鉴定肌肉组织特异性顺式调控元件有助于解释肌肉形成的遗传基础。同类调控元件在表达模式相同的基因之间可能存在保守的序列特征。研究通过分析斑马鱼多个组织的转录组测序数据,筛选出肌肉高表达基因及低表达基因。通过MEME对肌肉高表达基因和低表达基因的非编码区序列特征分析,在5个肌肉高表达基因的转录起始位点上游发现了序列保守的DNA区域,包含6个排列顺序一致的DNA基序。将其中一段目标片段插入具有Tol2转座子元件的基础启动子驱动的eGFP编码基因的上游,构建表达载体。注射载体至斑马鱼受精卵获得转基因胚胎,分析胚胎中eGFP荧光的表达模式,发现该DNA片段具有增强基因在肌肉特异性表达的功能。Tomtom预测该DNA区域可能作为Myod多个转录因子的结合位点。研究结果有助于我们更好地理解鱼类肌肉基因表达的遗传基础,并为利用生物信息学方法预测组织特异性转录调控元件提供新思路。